台灣蝙蝠種類有36種，但專門介紹牠們的活動和媒材其實不多，這也影響到台灣蝙蝠的保育成效。由本館館長引領的台灣永續聯盟自2002年起每年都在雲林水林蘇秦村舉辦蝙蝠營隊、蝙蝠志工培訓或是蝙蝠工作坊活動，讓民眾可以第一手獲得台灣蝙蝠的新知，迄今已連續舉辦16次的營隊或工作坊，以下是例年辦理的活動花絮。
2009年彩繪幸蝠-小小生態學家製作棕簑蝙蝠
2009蝙蝠志工培訓營-科學志工彩繪蝙蝠屋
2009年蝙蝠志工培訓營-合照
2010年蝙蝠營-志工分組限制人數進入引水洞觀察蝙蝠
2010年蝙蝠營-欣賞黃金蝙蝠
2010年蝙蝠營-製作黃金蝙蝠燈籠
2010年蝙蝠營-學員在台南山上淨水廠探洞後合影
2011年蝙蝠營 -蝙蝠餅乾製作
2011年蝙蝠營-台灣葉鼻蝠摺紙活動
2011年蝙蝠營-參觀新竹黑蝙蝠中隊文物館
2011年蝙蝠營-蝙蝠紙浮雕製作
2012年生物多樣性監測營-靜宜大學蝙蝠專班合影
2013年蝙蝠志工培訓營-林佩羿獸醫講解蝙蝠保定
2013年蝙蝠志工培訓營-陳宏彰秘書長授課蝙蝠與公共衛生
2013年蝙蝠志工培訓營-進入下水道找蝙蝠
2013年蝙蝠志工培訓營-嘉大方引平老師講解洞穴蝙蝠生態
2014年蝙蝠志工培訓營-合照
2014年蝙蝠志工培訓營-黃金蝙蝠布袋戲演出
2014年蝙蝠志工培訓營-蝙蝠屋分組調查實作
2014年蝙蝠志工培訓營-館長正在介紹黃金蝙蝠
2015年蝙蝠志工培訓營-入蝙蝠洞前先做好功課降低干擾
2015年蝙蝠志工培訓營-特生鄭錫奇老師授課
2015年蝙蝠志工培訓營-張恒嘉館長蝙蝠屋發展史的課程
2016年黃金蝙蝠營-分組洞穴尋蝠
2016年黃金蝙蝠營-台大李玲玲教授授課
2016年黃金蝙蝠營-尋找玄彩蝠儀器操作說明
2016年黃金蝙蝠營-蝙蝠捕捉標放課程
2016年黃金蝙蝠營-豎琴網捕捉東亞家蝠
2017年黃金蝙蝠營-入蝙蝠洞前先要求遵守尋蝠原則以降低干擾
2017年黃金蝙蝠營-洞穴中的台灣葉鼻蝠
2017年黃金蝙蝠營-蝙蝠屋DIY
2017年黃金蝙蝠營-蝙蝠測量健檢中
2017年黃金蝙蝠營-觀察高頭蝠
媒體報導